Protein–RNA interactions for Protein: P38398

BRCA1, Breast cancer type 1 susceptibility protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA1P38398 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRCA1P38398 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRCA1P38398 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRCA1P38398 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRCA1P38398 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRCA1P38398 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRCA1P38398 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRCA1P38398 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRCA1P38398 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
BRCA1P38398 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRCA1P38398 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
BRCA1P38398 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRCA1P38398 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRCA1P38398 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRCA1P38398 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRCA1P38398 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRCA1P38398 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRCA1P38398 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRCA1P38398 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BRCA1P38398 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRCA1P38398 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
BRCA1P38398 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
BRCA1P38398 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC24■■□□□ 1.43
BRCA1P38398 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRCA1P38398 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BRCA1P38398 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24■■□□□ 1.43
BRCA1P38398 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.5 ms