Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPC1P35052 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPC1P35052 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPC1P35052 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPC1P35052 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPC1P35052 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPC1P35052 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPC1P35052 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPC1P35052 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPC1P35052 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPC1P35052 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPC1P35052 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPC1P35052 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPC1P35052 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPC1P35052 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPC1P35052 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GPC1P35052 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPC1P35052 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPC1P35052 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPC1P35052 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPC1P35052 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPC1P35052 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPC1P35052 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPC1P35052 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPC1P35052 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPC1P35052 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPC1P35052 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPC1P35052 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GPC1P35052 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPC1P35052 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPC1P35052 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPC1P35052 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPC1P35052 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPC1P35052 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPC1P35052 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPC1P35052 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPC1P35052 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPC1P35052 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPC1P35052 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GPC1P35052 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPC1P35052 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPC1P35052 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPC1P35052 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPC1P35052 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPC1P35052 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPC1P35052 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPC1P35052 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPC1P35052 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPC1P35052 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPC1P35052 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPC1P35052 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPC1P35052 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPC1P35052 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPC1P35052 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPC1P35052 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPC1P35052 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPC1P35052 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPC1P35052 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPC1P35052 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPC1P35052 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPC1P35052 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GPC1P35052 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPC1P35052 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPC1P35052 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPC1P35052 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPC1P35052 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPC1P35052 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPC1P35052 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPC1P35052 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPC1P35052 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPC1P35052 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GPC1P35052 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
GPC1P35052 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPC1P35052 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPC1P35052 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPC1P35052 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPC1P35052 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPC1P35052 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPC1P35052 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPC1P35052 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPC1P35052 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPC1P35052 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPC1P35052 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GPC1P35052 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPC1P35052 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPC1P35052 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPC1P35052 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPC1P35052 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GPC1P35052 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GPC1P35052 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GPC1P35052 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPC1P35052 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPC1P35052 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPC1P35052 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPC1P35052 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPC1P35052 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPC1P35052 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPC1P35052 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPC1P35052 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPC1P35052 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms