Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASQ1P31415 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASQ1P31415 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASQ1P31415 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASQ1P31415 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASQ1P31415 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASQ1P31415 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASQ1P31415 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASQ1P31415 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASQ1P31415 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASQ1P31415 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASQ1P31415 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASQ1P31415 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASQ1P31415 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASQ1P31415 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASQ1P31415 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CASQ1P31415 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASQ1P31415 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASQ1P31415 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASQ1P31415 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASQ1P31415 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASQ1P31415 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASQ1P31415 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASQ1P31415 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASQ1P31415 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CASQ1P31415 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASQ1P31415 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CASQ1P31415 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CASQ1P31415 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CASQ1P31415 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CASQ1P31415 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CASQ1P31415 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CASQ1P31415 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CASQ1P31415 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CASQ1P31415 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CASQ1P31415 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CASQ1P31415 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CASQ1P31415 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CASQ1P31415 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
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CASQ1P31415 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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CASQ1P31415 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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CASQ1P31415 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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CASQ1P31415 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASQ1P31415 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASQ1P31415 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
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CASQ1P31415 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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CASQ1P31415 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASQ1P31415 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASQ1P31415 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASQ1P31415 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASQ1P31415 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CASQ1P31415 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CASQ1P31415 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CASQ1P31415 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASQ1P31415 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASQ1P31415 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASQ1P31415 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CASQ1P31415 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASQ1P31415 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CASQ1P31415 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CASQ1P31415 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASQ1P31415 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASQ1P31415 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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