Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CPS1P31327 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CPS1P31327 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CPS1P31327 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CPS1P31327 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CPS1P31327 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CPS1P31327 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CPS1P31327 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CPS1P31327 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CPS1P31327 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CPS1P31327 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CPS1P31327 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CPS1P31327 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CPS1P31327 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CPS1P31327 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CPS1P31327 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CPS1P31327 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CPS1P31327 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CPS1P31327 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CPS1P31327 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CPS1P31327 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CPS1P31327 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CPS1P31327 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CPS1P31327 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CPS1P31327 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CPS1P31327 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CPS1P31327 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CPS1P31327 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CPS1P31327 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CPS1P31327 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CPS1P31327 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CPS1P31327 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CPS1P31327 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CPS1P31327 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CPS1P31327 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CPS1P31327 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CPS1P31327 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CPS1P31327 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CPS1P31327 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CPS1P31327 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CPS1P31327 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CPS1P31327 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CPS1P31327 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CPS1P31327 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CPS1P31327 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CPS1P31327 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CPS1P31327 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CPS1P31327 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CPS1P31327 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CPS1P31327 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CPS1P31327 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CPS1P31327 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CPS1P31327 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CPS1P31327 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CPS1P31327 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CPS1P31327 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CPS1P31327 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CPS1P31327 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CPS1P31327 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CPS1P31327 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CPS1P31327 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CPS1P31327 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CPS1P31327 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CPS1P31327 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CPS1P31327 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CPS1P31327 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CPS1P31327 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CPS1P31327 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CPS1P31327 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CPS1P31327 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CPS1P31327 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CPS1P31327 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CPS1P31327 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CPS1P31327 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CPS1P31327 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CPS1P31327 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CPS1P31327 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CPS1P31327 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CPS1P31327 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CPS1P31327 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CPS1P31327 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CPS1P31327 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CPS1P31327 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CPS1P31327 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CPS1P31327 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CPS1P31327 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CPS1P31327 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CPS1P31327 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CPS1P31327 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CPS1P31327 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CPS1P31327 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CPS1P31327 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CPS1P31327 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CPS1P31327 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CPS1P31327 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CPS1P31327 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CPS1P31327 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CPS1P31327 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CPS1P31327 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CPS1P31327 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms