Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA11P31270 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA11P31270 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA11P31270 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HOXA11P31270 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA11P31270 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA11P31270 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA11P31270 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA11P31270 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA11P31270 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXA11P31270 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA11P31270 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA11P31270 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA11P31270 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA11P31270 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA11P31270 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA11P31270 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA11P31270 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA11P31270 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA11P31270 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA11P31270 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA11P31270 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA11P31270 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA11P31270 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA11P31270 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HOXA11P31270 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA11P31270 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA11P31270 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA11P31270 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA11P31270 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXA11P31270 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA11P31270 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA11P31270 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA11P31270 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA11P31270 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA11P31270 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA11P31270 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA11P31270 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA11P31270 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA11P31270 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA11P31270 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA11P31270 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA11P31270 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA11P31270 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HOXA11P31270 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA11P31270 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA11P31270 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HOXA11P31270 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA11P31270 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA11P31270 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA11P31270 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA11P31270 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms