Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARID4AP29374 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARID4AP29374 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARID4AP29374 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARID4AP29374 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARID4AP29374 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARID4AP29374 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARID4AP29374 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARID4AP29374 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ARID4AP29374 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARID4AP29374 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARID4AP29374 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ARID4AP29374 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARID4AP29374 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARID4AP29374 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARID4AP29374 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARID4AP29374 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARID4AP29374 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARID4AP29374 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARID4AP29374 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARID4AP29374 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARID4AP29374 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARID4AP29374 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms