Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP1P28562 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP1P28562 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms