Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABCD3P28288 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABCD3P28288 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCD3P28288 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCD3P28288 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCD3P28288 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCD3P28288 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCD3P28288 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCD3P28288 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCD3P28288 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCD3P28288 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCD3P28288 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCD3P28288 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCD3P28288 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCD3P28288 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCD3P28288 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCD3P28288 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCD3P28288 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCD3P28288 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCD3P28288 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCD3P28288 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCD3P28288 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCD3P28288 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCD3P28288 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCD3P28288 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCD3P28288 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCD3P28288 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCD3P28288 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCD3P28288 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCD3P28288 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCD3P28288 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCD3P28288 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCD3P28288 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCD3P28288 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCD3P28288 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCD3P28288 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCD3P28288 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCD3P28288 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCD3P28288 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCD3P28288 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCD3P28288 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCD3P28288 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCD3P28288 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCD3P28288 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCD3P28288 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCD3P28288 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCD3P28288 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCD3P28288 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCD3P28288 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCD3P28288 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCD3P28288 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCD3P28288 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCD3P28288 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCD3P28288 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCD3P28288 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCD3P28288 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCD3P28288 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCD3P28288 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCD3P28288 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCD3P28288 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCD3P28288 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCD3P28288 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCD3P28288 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCD3P28288 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCD3P28288 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCD3P28288 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCD3P28288 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCD3P28288 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCD3P28288 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCD3P28288 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABCD3P28288 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABCD3P28288 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABCD3P28288 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABCD3P28288 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABCD3P28288 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms