Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNTFRP26992 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNTFRP26992 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms