Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMLP26374 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMLP26374 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMLP26374 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMLP26374 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMLP26374 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMLP26374 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMLP26374 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMLP26374 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMLP26374 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMLP26374 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMLP26374 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMLP26374 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMLP26374 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMLP26374 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMLP26374 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMLP26374 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMLP26374 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHMLP26374 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMLP26374 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMLP26374 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMLP26374 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMLP26374 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMLP26374 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMLP26374 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMLP26374 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMLP26374 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMLP26374 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMLP26374 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMLP26374 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMLP26374 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMLP26374 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMLP26374 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMLP26374 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMLP26374 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CHMLP26374 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMLP26374 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMLP26374 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMLP26374 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMLP26374 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMLP26374 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMLP26374 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMLP26374 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMLP26374 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMLP26374 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMLP26374 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMLP26374 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMLP26374 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMLP26374 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMLP26374 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMLP26374 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMLP26374 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMLP26374 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMLP26374 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMLP26374 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMLP26374 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMLP26374 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMLP26374 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMLP26374 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMLP26374 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHMLP26374 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMLP26374 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMLP26374 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMLP26374 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMLP26374 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMLP26374 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMLP26374 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMLP26374 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMLP26374 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMLP26374 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMLP26374 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMLP26374 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHMLP26374 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMLP26374 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMLP26374 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMLP26374 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMLP26374 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMLP26374 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMLP26374 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMLP26374 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMLP26374 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMLP26374 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMLP26374 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMLP26374 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMLP26374 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMLP26374 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMLP26374 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMLP26374 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMLP26374 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMLP26374 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMLP26374 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMLP26374 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMLP26374 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMLP26374 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMLP26374 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMLP26374 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMLP26374 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMLP26374 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHMLP26374 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CHMLP26374 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms