Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms