Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms