Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYF6P23409 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYF6P23409 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYF6P23409 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYF6P23409 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYF6P23409 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYF6P23409 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYF6P23409 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MYF6P23409 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MYF6P23409 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MYF6P23409 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MYF6P23409 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MYF6P23409 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MYF6P23409 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MYF6P23409 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MYF6P23409 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MYF6P23409 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MYF6P23409 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MYF6P23409 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MYF6P23409 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MYF6P23409 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MYF6P23409 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MYF6P23409 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MYF6P23409 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MYF6P23409 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MYF6P23409 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MYF6P23409 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MYF6P23409 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MYF6P23409 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MYF6P23409 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MYF6P23409 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MYF6P23409 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MYF6P23409 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYF6P23409 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYF6P23409 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYF6P23409 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYF6P23409 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYF6P23409 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYF6P23409 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYF6P23409 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYF6P23409 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYF6P23409 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYF6P23409 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYF6P23409 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYF6P23409 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYF6P23409 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MYF6P23409 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYF6P23409 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYF6P23409 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYF6P23409 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYF6P23409 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYF6P23409 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYF6P23409 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYF6P23409 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYF6P23409 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYF6P23409 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYF6P23409 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYF6P23409 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MYF6P23409 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MYF6P23409 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MYF6P23409 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MYF6P23409 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MYF6P23409 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MYF6P23409 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MYF6P23409 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MYF6P23409 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MYF6P23409 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MYF6P23409 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MYF6P23409 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MYF6P23409 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MYF6P23409 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MYF6P23409 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MYF6P23409 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MYF6P23409 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MYF6P23409 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MYF6P23409 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MYF6P23409 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MYF6P23409 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MYF6P23409 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MYF6P23409 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MYF6P23409 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MYF6P23409 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MYF6P23409 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MYF6P23409 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MYF6P23409 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MYF6P23409 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MYF6P23409 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MYF6P23409 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MYF6P23409 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MYF6P23409 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MYF6P23409 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MYF6P23409 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MYF6P23409 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MYF6P23409 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MYF6P23409 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MYF6P23409 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MYF6P23409 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MYF6P23409 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MYF6P23409 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MYF6P23409 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms