Protein–RNA interactions for Protein: P23378

GLDC, Glycine dehydrogenase (decarboxylating), mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLDCP23378 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLDCP23378 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLDCP23378 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLDCP23378 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLDCP23378 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLDCP23378 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLDCP23378 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLDCP23378 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLDCP23378 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLDCP23378 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLDCP23378 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GLDCP23378 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLDCP23378 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLDCP23378 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLDCP23378 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLDCP23378 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLDCP23378 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLDCP23378 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLDCP23378 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLDCP23378 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GLDCP23378 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GLDCP23378 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GLDCP23378 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GLDCP23378 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GLDCP23378 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GLDCP23378 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GLDCP23378 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GLDCP23378 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GLDCP23378 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GLDCP23378 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GLDCP23378 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GLDCP23378 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GLDCP23378 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GLDCP23378 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GLDCP23378 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GLDCP23378 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GLDCP23378 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GLDCP23378 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLDCP23378 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLDCP23378 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLDCP23378 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLDCP23378 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLDCP23378 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLDCP23378 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLDCP23378 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLDCP23378 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLDCP23378 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLDCP23378 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLDCP23378 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLDCP23378 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLDCP23378 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLDCP23378 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLDCP23378 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GLDCP23378 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLDCP23378 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLDCP23378 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLDCP23378 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLDCP23378 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLDCP23378 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLDCP23378 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLDCP23378 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLDCP23378 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLDCP23378 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLDCP23378 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLDCP23378 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLDCP23378 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLDCP23378 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLDCP23378 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GLDCP23378 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLDCP23378 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLDCP23378 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLDCP23378 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLDCP23378 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLDCP23378 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLDCP23378 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLDCP23378 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GLDCP23378 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GLDCP23378 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GLDCP23378 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GLDCP23378 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GLDCP23378 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GLDCP23378 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GLDCP23378 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GLDCP23378 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GLDCP23378 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GLDCP23378 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GLDCP23378 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GLDCP23378 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GLDCP23378 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GLDCP23378 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GLDCP23378 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GLDCP23378 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GLDCP23378 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GLDCP23378 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GLDCP23378 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GLDCP23378 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GLDCP23378 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GLDCP23378 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GLDCP23378 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GLDCP23378 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms