Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDCP20941 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCP20941 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCP20941 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCP20941 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCP20941 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCP20941 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCP20941 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCP20941 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCP20941 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCP20941 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCP20941 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCP20941 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCP20941 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCP20941 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCP20941 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCP20941 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCP20941 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCP20941 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCP20941 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCP20941 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCP20941 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCP20941 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCP20941 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCP20941 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCP20941 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCP20941 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCP20941 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCP20941 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCP20941 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCP20941 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCP20941 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCP20941 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCP20941 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCP20941 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCP20941 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCP20941 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCP20941 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCP20941 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCP20941 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCP20941 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCP20941 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCP20941 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCP20941 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCP20941 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCP20941 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCP20941 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCP20941 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCP20941 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCP20941 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCP20941 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCP20941 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCP20941 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCP20941 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCP20941 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCP20941 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCP20941 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCP20941 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCP20941 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCP20941 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCP20941 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCP20941 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCP20941 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCP20941 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCP20941 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCP20941 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCP20941 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCP20941 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCP20941 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCP20941 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCP20941 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCP20941 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCP20941 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCP20941 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCP20941 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCP20941 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCP20941 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCP20941 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCP20941 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCP20941 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCP20941 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCP20941 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCP20941 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCP20941 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCP20941 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCP20941 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCP20941 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCP20941 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCP20941 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCP20941 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCP20941 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCP20941 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCP20941 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCP20941 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCP20941 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCP20941 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCP20941 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCP20941 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCP20941 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCP20941 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms