Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP4AP20648 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms