Protein–RNA interactions for Protein: P16112

ACAN, Aggrecan core protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACANP16112 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACANP16112 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACANP16112 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACANP16112 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACANP16112 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACANP16112 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACANP16112 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACANP16112 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACANP16112 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACANP16112 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACANP16112 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACANP16112 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACANP16112 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACANP16112 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACANP16112 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACANP16112 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACANP16112 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACANP16112 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACANP16112 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACANP16112 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACANP16112 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACANP16112 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACANP16112 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACANP16112 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACANP16112 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACANP16112 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACANP16112 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACANP16112 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACANP16112 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACANP16112 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACANP16112 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACANP16112 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACANP16112 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACANP16112 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACANP16112 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACANP16112 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACANP16112 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACANP16112 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ACANP16112 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACANP16112 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACANP16112 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACANP16112 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACANP16112 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACANP16112 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACANP16112 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACANP16112 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACANP16112 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACANP16112 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACANP16112 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ACANP16112 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACANP16112 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACANP16112 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACANP16112 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACANP16112 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACANP16112 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACANP16112 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACANP16112 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACANP16112 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACANP16112 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACANP16112 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACANP16112 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACANP16112 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACANP16112 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACANP16112 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACANP16112 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACANP16112 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACANP16112 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACANP16112 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACANP16112 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ACANP16112 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACANP16112 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACANP16112 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACANP16112 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACANP16112 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACANP16112 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACANP16112 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACANP16112 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACANP16112 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACANP16112 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACANP16112 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACANP16112 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ACANP16112 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ACANP16112 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACANP16112 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACANP16112 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACANP16112 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACANP16112 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACANP16112 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ACANP16112 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACANP16112 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACANP16112 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACANP16112 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACANP16112 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ACANP16112 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACANP16112 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACANP16112 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACANP16112 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACANP16112 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACANP16112 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACANP16112 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms