Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DSPP15924 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
DSPP15924 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DSPP15924 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DSPP15924 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSPP15924 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSPP15924 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSPP15924 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSPP15924 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DSPP15924 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSPP15924 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSPP15924 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSPP15924 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSPP15924 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSPP15924 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSPP15924 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSPP15924 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSPP15924 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSPP15924 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSPP15924 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSPP15924 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSPP15924 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSPP15924 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSPP15924 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DSPP15924 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSPP15924 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSPP15924 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSPP15924 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSPP15924 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSPP15924 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSPP15924 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSPP15924 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSPP15924 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSPP15924 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSPP15924 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSPP15924 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSPP15924 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSPP15924 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSPP15924 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSPP15924 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DSPP15924 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSPP15924 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSPP15924 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSPP15924 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSPP15924 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DSPP15924 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSPP15924 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSPP15924 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSPP15924 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSPP15924 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DSPP15924 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSPP15924 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSPP15924 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSPP15924 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSPP15924 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSPP15924 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSPP15924 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSPP15924 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSPP15924 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSPP15924 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSPP15924 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSPP15924 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSPP15924 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DSPP15924 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSPP15924 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSPP15924 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSPP15924 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSPP15924 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSPP15924 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSPP15924 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSPP15924 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSPP15924 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSPP15924 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DSPP15924 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSPP15924 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSPP15924 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSPP15924 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSPP15924 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSPP15924 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DSPP15924 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSPP15924 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSPP15924 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DSPP15924 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSPP15924 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSPP15924 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSPP15924 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DSPP15924 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSPP15924 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSPP15924 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSPP15924 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSPP15924 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSPP15924 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSPP15924 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSPP15924 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSPP15924 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSPP15924 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DSPP15924 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSPP15924 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSPP15924 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DSPP15924 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms