Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CFTRP13569 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CFTRP13569 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
CFTRP13569 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CFTRP13569 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CFTRP13569 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CFTRP13569 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CFTRP13569 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CFTRP13569 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CFTRP13569 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
CFTRP13569 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CFTRP13569 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CFTRP13569 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CFTRP13569 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CFTRP13569 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CFTRP13569 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
CFTRP13569 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CFTRP13569 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CFTRP13569 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CFTRP13569 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CFTRP13569 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CFTRP13569 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CFTRP13569 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CFTRP13569 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CFTRP13569 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CFTRP13569 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CFTRP13569 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CFTRP13569 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CFTRP13569 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CFTRP13569 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CFTRP13569 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CFTRP13569 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CFTRP13569 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CFTRP13569 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CFTRP13569 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CFTRP13569 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CFTRP13569 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
CFTRP13569 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
CFTRP13569 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
CFTRP13569 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3.01
CFTRP13569 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC33.82■■■■□ 3.01
CFTRP13569 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
CFTRP13569 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
CFTRP13569 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CFTRP13569 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CFTRP13569 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
CFTRP13569 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CFTRP13569 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CFTRP13569 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CFTRP13569 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CFTRP13569 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC33.82■■■■□ 3
CFTRP13569 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CFTRP13569 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CFTRP13569 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
CFTRP13569 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC33.81■■■■□ 3
CFTRP13569 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CFTRP13569 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
CFTRP13569 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
CFTRP13569 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
CFTRP13569 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CFTRP13569 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CFTRP13569 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
CFTRP13569 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CFTRP13569 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
CFTRP13569 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CFTRP13569 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CFTRP13569 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CFTRP13569 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
CFTRP13569 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
CFTRP13569 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
CFTRP13569 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CFTRP13569 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CFTRP13569 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CFTRP13569 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CFTRP13569 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CFTRP13569 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
CFTRP13569 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC33.79■■■■□ 3
CFTRP13569 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CFTRP13569 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CFTRP13569 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CFTRP13569 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
CFTRP13569 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CFTRP13569 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
CFTRP13569 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
CFTRP13569 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CFTRP13569 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
CFTRP13569 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CFTRP13569 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC33.78■■■■□ 3
CFTRP13569 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
CFTRP13569 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CFTRP13569 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
CFTRP13569 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
CFTRP13569 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CFTRP13569 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
CFTRP13569 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CFTRP13569 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CFTRP13569 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CFTRP13569 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CFTRP13569 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CFTRP13569 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms