Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYL1P12980 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYL1P12980 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LYL1P12980 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYL1P12980 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYL1P12980 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYL1P12980 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LYL1P12980 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYL1P12980 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYL1P12980 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYL1P12980 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYL1P12980 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYL1P12980 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYL1P12980 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYL1P12980 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYL1P12980 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYL1P12980 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYL1P12980 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYL1P12980 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYL1P12980 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LYL1P12980 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYL1P12980 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYL1P12980 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYL1P12980 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYL1P12980 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYL1P12980 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYL1P12980 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYL1P12980 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYL1P12980 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYL1P12980 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYL1P12980 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYL1P12980 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYL1P12980 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYL1P12980 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYL1P12980 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LYL1P12980 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LYL1P12980 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYL1P12980 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYL1P12980 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYL1P12980 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYL1P12980 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYL1P12980 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYL1P12980 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYL1P12980 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYL1P12980 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYL1P12980 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYL1P12980 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYL1P12980 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LYL1P12980 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYL1P12980 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYL1P12980 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYL1P12980 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYL1P12980 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYL1P12980 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYL1P12980 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYL1P12980 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYL1P12980 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYL1P12980 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYL1P12980 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYL1P12980 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYL1P12980 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYL1P12980 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYL1P12980 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYL1P12980 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYL1P12980 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYL1P12980 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYL1P12980 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LYL1P12980 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYL1P12980 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYL1P12980 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYL1P12980 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYL1P12980 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYL1P12980 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYL1P12980 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYL1P12980 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYL1P12980 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LYL1P12980 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYL1P12980 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYL1P12980 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYL1P12980 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYL1P12980 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYL1P12980 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYL1P12980 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYL1P12980 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYL1P12980 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYL1P12980 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYL1P12980 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYL1P12980 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYL1P12980 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYL1P12980 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LYL1P12980 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYL1P12980 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYL1P12980 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYL1P12980 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYL1P12980 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYL1P12980 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYL1P12980 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYL1P12980 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYL1P12980 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYL1P12980 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms