Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDH1P12830 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDH1P12830 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDH1P12830 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDH1P12830 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CDH1P12830 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDH1P12830 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDH1P12830 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDH1P12830 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDH1P12830 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDH1P12830 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDH1P12830 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDH1P12830 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDH1P12830 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDH1P12830 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDH1P12830 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDH1P12830 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDH1P12830 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDH1P12830 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDH1P12830 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDH1P12830 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDH1P12830 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDH1P12830 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDH1P12830 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDH1P12830 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDH1P12830 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDH1P12830 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDH1P12830 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDH1P12830 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDH1P12830 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CDH1P12830 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDH1P12830 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDH1P12830 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDH1P12830 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDH1P12830 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDH1P12830 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDH1P12830 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDH1P12830 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDH1P12830 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDH1P12830 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDH1P12830 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDH1P12830 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDH1P12830 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDH1P12830 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDH1P12830 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDH1P12830 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDH1P12830 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDH1P12830 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDH1P12830 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDH1P12830 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDH1P12830 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDH1P12830 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDH1P12830 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDH1P12830 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDH1P12830 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CDH1P12830 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CDH1P12830 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDH1P12830 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDH1P12830 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDH1P12830 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDH1P12830 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDH1P12830 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDH1P12830 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDH1P12830 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDH1P12830 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDH1P12830 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDH1P12830 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDH1P12830 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDH1P12830 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDH1P12830 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDH1P12830 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDH1P12830 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDH1P12830 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDH1P12830 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDH1P12830 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDH1P12830 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDH1P12830 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDH1P12830 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDH1P12830 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDH1P12830 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDH1P12830 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDH1P12830 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDH1P12830 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDH1P12830 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDH1P12830 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDH1P12830 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDH1P12830 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDH1P12830 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDH1P12830 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CDH1P12830 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CDH1P12830 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDH1P12830 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDH1P12830 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDH1P12830 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDH1P12830 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDH1P12830 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDH1P12830 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDH1P12830 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDH1P12830 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDH1P12830 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms