Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTN1P12814 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms