Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ODC1P11926 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ODC1P11926 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ODC1P11926 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ODC1P11926 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ODC1P11926 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ODC1P11926 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ODC1P11926 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ODC1P11926 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ODC1P11926 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ODC1P11926 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ODC1P11926 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ODC1P11926 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ODC1P11926 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ODC1P11926 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ODC1P11926 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ODC1P11926 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ODC1P11926 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ODC1P11926 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ODC1P11926 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ODC1P11926 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ODC1P11926 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ODC1P11926 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ODC1P11926 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ODC1P11926 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ODC1P11926 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ODC1P11926 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ODC1P11926 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ODC1P11926 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ODC1P11926 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ODC1P11926 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ODC1P11926 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ODC1P11926 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ODC1P11926 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ODC1P11926 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ODC1P11926 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ODC1P11926 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ODC1P11926 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ODC1P11926 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ODC1P11926 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ODC1P11926 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ODC1P11926 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ODC1P11926 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ODC1P11926 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ODC1P11926 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ODC1P11926 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ODC1P11926 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ODC1P11926 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ODC1P11926 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ODC1P11926 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ODC1P11926 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ODC1P11926 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ODC1P11926 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ODC1P11926 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ODC1P11926 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ODC1P11926 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ODC1P11926 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ODC1P11926 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ODC1P11926 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ODC1P11926 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ODC1P11926 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ODC1P11926 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ODC1P11926 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ODC1P11926 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ODC1P11926 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ODC1P11926 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ODC1P11926 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ODC1P11926 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ODC1P11926 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ODC1P11926 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ODC1P11926 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ODC1P11926 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ODC1P11926 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ODC1P11926 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ODC1P11926 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ODC1P11926 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ODC1P11926 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ODC1P11926 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ODC1P11926 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ODC1P11926 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ODC1P11926 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ODC1P11926 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ODC1P11926 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ODC1P11926 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ODC1P11926 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ODC1P11926 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ODC1P11926 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ODC1P11926 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ODC1P11926 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ODC1P11926 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ODC1P11926 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ODC1P11926 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ODC1P11926 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ODC1P11926 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ODC1P11926 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ODC1P11926 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ODC1P11926 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ODC1P11926 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ODC1P11926 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ODC1P11926 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms