Protein–RNA interactions for Protein: P11597

CETP, Cholesteryl ester transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CETPP11597 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CETPP11597 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CETPP11597 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CETPP11597 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CETPP11597 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CETPP11597 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CETPP11597 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CETPP11597 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CETPP11597 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CETPP11597 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CETPP11597 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CETPP11597 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CETPP11597 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CETPP11597 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CETPP11597 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CETPP11597 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CETPP11597 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CETPP11597 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CETPP11597 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CETPP11597 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CETPP11597 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CETPP11597 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CETPP11597 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CETPP11597 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CETPP11597 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CETPP11597 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CETPP11597 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CETPP11597 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CETPP11597 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CETPP11597 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CETPP11597 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CETPP11597 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CETPP11597 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CETPP11597 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CETPP11597 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CETPP11597 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CETPP11597 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CETPP11597 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CETPP11597 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CETPP11597 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CETPP11597 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CETPP11597 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CETPP11597 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CETPP11597 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CETPP11597 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CETPP11597 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CETPP11597 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CETPP11597 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CETPP11597 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CETPP11597 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CETPP11597 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CETPP11597 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CETPP11597 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CETPP11597 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CETPP11597 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CETPP11597 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CETPP11597 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CETPP11597 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CETPP11597 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CETPP11597 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CETPP11597 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CETPP11597 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CETPP11597 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CETPP11597 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CETPP11597 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CETPP11597 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CETPP11597 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CETPP11597 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CETPP11597 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CETPP11597 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CETPP11597 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CETPP11597 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CETPP11597 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CETPP11597 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CETPP11597 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CETPP11597 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CETPP11597 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CETPP11597 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CETPP11597 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CETPP11597 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CETPP11597 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CETPP11597 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CETPP11597 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CETPP11597 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CETPP11597 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CETPP11597 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CETPP11597 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CETPP11597 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CETPP11597 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CETPP11597 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CETPP11597 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CETPP11597 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CETPP11597 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CETPP11597 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CETPP11597 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CETPP11597 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CETPP11597 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CETPP11597 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CETPP11597 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CETPP11597 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms