Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD8BP10966 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CD8BP10966 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD8BP10966 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD8BP10966 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD8BP10966 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD8BP10966 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD8BP10966 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD8BP10966 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD8BP10966 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD8BP10966 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD8BP10966 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD8BP10966 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD8BP10966 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD8BP10966 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD8BP10966 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD8BP10966 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD8BP10966 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD8BP10966 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD8BP10966 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD8BP10966 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD8BP10966 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD8BP10966 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD8BP10966 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD8BP10966 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD8BP10966 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD8BP10966 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD8BP10966 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CD8BP10966 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD8BP10966 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD8BP10966 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD8BP10966 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD8BP10966 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD8BP10966 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD8BP10966 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD8BP10966 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD8BP10966 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD8BP10966 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD8BP10966 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD8BP10966 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD8BP10966 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD8BP10966 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD8BP10966 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CD8BP10966 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD8BP10966 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CD8BP10966 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CD8BP10966 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD8BP10966 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD8BP10966 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD8BP10966 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD8BP10966 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD8BP10966 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD8BP10966 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD8BP10966 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD8BP10966 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD8BP10966 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD8BP10966 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD8BP10966 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD8BP10966 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD8BP10966 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD8BP10966 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD8BP10966 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD8BP10966 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CD8BP10966 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD8BP10966 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD8BP10966 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD8BP10966 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD8BP10966 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD8BP10966 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD8BP10966 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD8BP10966 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD8BP10966 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD8BP10966 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD8BP10966 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD8BP10966 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CD8BP10966 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD8BP10966 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD8BP10966 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD8BP10966 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD8BP10966 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD8BP10966 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD8BP10966 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD8BP10966 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD8BP10966 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD8BP10966 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD8BP10966 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD8BP10966 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CD8BP10966 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CD8BP10966 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD8BP10966 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD8BP10966 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD8BP10966 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD8BP10966 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD8BP10966 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD8BP10966 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD8BP10966 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD8BP10966 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD8BP10966 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD8BP10966 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CD8BP10966 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms