Protein–RNA interactions for Protein: P10747

CD28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD28P10747 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD28P10747 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD28P10747 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD28P10747 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD28P10747 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD28P10747 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD28P10747 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD28P10747 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD28P10747 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD28P10747 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD28P10747 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD28P10747 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD28P10747 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD28P10747 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD28P10747 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD28P10747 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD28P10747 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD28P10747 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD28P10747 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD28P10747 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD28P10747 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD28P10747 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD28P10747 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CD28P10747 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD28P10747 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD28P10747 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD28P10747 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD28P10747 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD28P10747 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD28P10747 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD28P10747 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CD28P10747 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD28P10747 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD28P10747 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CD28P10747 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD28P10747 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD28P10747 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD28P10747 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD28P10747 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD28P10747 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD28P10747 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD28P10747 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD28P10747 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CD28P10747 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD28P10747 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD28P10747 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD28P10747 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD28P10747 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD28P10747 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD28P10747 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD28P10747 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD28P10747 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD28P10747 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD28P10747 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD28P10747 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD28P10747 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD28P10747 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD28P10747 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD28P10747 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD28P10747 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD28P10747 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD28P10747 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD28P10747 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD28P10747 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD28P10747 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD28P10747 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD28P10747 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD28P10747 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD28P10747 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD28P10747 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD28P10747 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD28P10747 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD28P10747 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD28P10747 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD28P10747 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD28P10747 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD28P10747 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD28P10747 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD28P10747 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD28P10747 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD28P10747 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD28P10747 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD28P10747 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD28P10747 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CD28P10747 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD28P10747 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD28P10747 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD28P10747 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CD28P10747 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD28P10747 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD28P10747 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD28P10747 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD28P10747 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD28P10747 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD28P10747 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD28P10747 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD28P10747 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD28P10747 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CD28P10747 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD28P10747 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms