Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB5P09067 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms