Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGAP02671 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGAP02671 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGAP02671 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGAP02671 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGAP02671 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGAP02671 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGAP02671 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FGAP02671 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FGAP02671 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FGAP02671 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FGAP02671 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FGAP02671 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FGAP02671 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FGAP02671 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
FGAP02671 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FGAP02671 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FGAP02671 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FGAP02671 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FGAP02671 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FGAP02671 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FGAP02671 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FGAP02671 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
FGAP02671 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FGAP02671 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FGAP02671 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FGAP02671 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FGAP02671 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FGAP02671 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FGAP02671 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FGAP02671 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGAP02671 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGAP02671 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGAP02671 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGAP02671 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGAP02671 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGAP02671 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGAP02671 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGAP02671 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGAP02671 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGAP02671 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGAP02671 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGAP02671 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGAP02671 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGAP02671 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGAP02671 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGAP02671 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGAP02671 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGAP02671 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGAP02671 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FGAP02671 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGAP02671 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGAP02671 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGAP02671 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGAP02671 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGAP02671 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGAP02671 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGAP02671 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGAP02671 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGAP02671 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGAP02671 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGAP02671 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGAP02671 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGAP02671 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGAP02671 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FGAP02671 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGAP02671 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGAP02671 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGAP02671 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGAP02671 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGAP02671 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGAP02671 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGAP02671 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGAP02671 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FGAP02671 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGAP02671 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGAP02671 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGAP02671 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGAP02671 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGAP02671 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGAP02671 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGAP02671 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGAP02671 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGAP02671 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGAP02671 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGAP02671 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGAP02671 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGAP02671 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGAP02671 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGAP02671 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGAP02671 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGAP02671 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGAP02671 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGAP02671 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGAP02671 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGAP02671 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGAP02671 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGAP02671 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGAP02671 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGAP02671 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms