Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC1P02654 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC1P02654 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC1P02654 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC1P02654 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC1P02654 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC1P02654 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC1P02654 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC1P02654 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC1P02654 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC1P02654 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC1P02654 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC1P02654 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC1P02654 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC1P02654 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC1P02654 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC1P02654 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC1P02654 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC1P02654 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC1P02654 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC1P02654 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC1P02654 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC1P02654 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC1P02654 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC1P02654 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC1P02654 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC1P02654 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC1P02654 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC1P02654 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC1P02654 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC1P02654 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC1P02654 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC1P02654 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC1P02654 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC1P02654 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC1P02654 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC1P02654 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC1P02654 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC1P02654 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC1P02654 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC1P02654 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC1P02654 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC1P02654 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC1P02654 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC1P02654 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC1P02654 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC1P02654 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC1P02654 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC1P02654 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC1P02654 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC1P02654 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC1P02654 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC1P02654 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC1P02654 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC1P02654 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC1P02654 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC1P02654 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC1P02654 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC1P02654 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC1P02654 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOC1P02654 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC1P02654 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC1P02654 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC1P02654 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC1P02654 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC1P02654 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC1P02654 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC1P02654 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC1P02654 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC1P02654 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC1P02654 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC1P02654 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC1P02654 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC1P02654 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC1P02654 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC1P02654 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC1P02654 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC1P02654 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC1P02654 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC1P02654 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC1P02654 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC1P02654 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC1P02654 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC1P02654 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC1P02654 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC1P02654 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOC1P02654 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOC1P02654 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOC1P02654 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOC1P02654 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOC1P02654 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOC1P02654 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOC1P02654 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOC1P02654 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOC1P02654 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOC1P02654 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOC1P02654 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOC1P02654 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOC1P02654 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOC1P02654 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms