Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EGFRP00533 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EGFRP00533 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EGFRP00533 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EGFRP00533 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EGFRP00533 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EGFRP00533 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EGFRP00533 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EGFRP00533 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EGFRP00533 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EGFRP00533 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EGFRP00533 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EGFRP00533 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EGFRP00533 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EGFRP00533 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EGFRP00533 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EGFRP00533 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EGFRP00533 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EGFRP00533 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EGFRP00533 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EGFRP00533 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EGFRP00533 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EGFRP00533 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EGFRP00533 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EGFRP00533 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EGFRP00533 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EGFRP00533 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EGFRP00533 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EGFRP00533 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EGFRP00533 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EGFRP00533 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EGFRP00533 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EGFRP00533 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EGFRP00533 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EGFRP00533 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EGFRP00533 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EGFRP00533 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EGFRP00533 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EGFRP00533 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EGFRP00533 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EGFRP00533 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EGFRP00533 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EGFRP00533 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EGFRP00533 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EGFRP00533 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EGFRP00533 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EGFRP00533 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EGFRP00533 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EGFRP00533 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EGFRP00533 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EGFRP00533 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EGFRP00533 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EGFRP00533 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EGFRP00533 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EGFRP00533 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EGFRP00533 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EGFRP00533 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EGFRP00533 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EGFRP00533 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EGFRP00533 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EGFRP00533 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EGFRP00533 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EGFRP00533 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EGFRP00533 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EGFRP00533 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EGFRP00533 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EGFRP00533 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EGFRP00533 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
EGFRP00533 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
EGFRP00533 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
EGFRP00533 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EGFRP00533 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EGFRP00533 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
EGFRP00533 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EGFRP00533 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EGFRP00533 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EGFRP00533 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EGFRP00533 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EGFRP00533 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EGFRP00533 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EGFRP00533 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EGFRP00533 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EGFRP00533 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EGFRP00533 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EGFRP00533 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EGFRP00533 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EGFRP00533 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EGFRP00533 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EGFRP00533 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EGFRP00533 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EGFRP00533 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EGFRP00533 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EGFRP00533 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EGFRP00533 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EGFRP00533 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EGFRP00533 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EGFRP00533 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EGFRP00533 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EGFRP00533 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EGFRP00533 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms