Protein–RNA interactions for Protein: O94805

ACTL6B, Actin-like protein 6B, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTL6BO94805 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTL6BO94805 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms