Protein–RNA interactions for Protein: O75177

SS18L1, Calcium-responsive transactivator, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L1O75177 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SS18L1O75177 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms