Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG13O75143 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG13O75143 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG13O75143 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG13O75143 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG13O75143 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG13O75143 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG13O75143 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG13O75143 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG13O75143 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG13O75143 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG13O75143 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG13O75143 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG13O75143 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG13O75143 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG13O75143 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG13O75143 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG13O75143 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG13O75143 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG13O75143 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG13O75143 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG13O75143 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG13O75143 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG13O75143 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG13O75143 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG13O75143 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG13O75143 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG13O75143 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG13O75143 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG13O75143 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG13O75143 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG13O75143 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG13O75143 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG13O75143 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG13O75143 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG13O75143 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG13O75143 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG13O75143 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG13O75143 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG13O75143 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG13O75143 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG13O75143 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG13O75143 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG13O75143 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG13O75143 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG13O75143 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG13O75143 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG13O75143 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG13O75143 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG13O75143 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG13O75143 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG13O75143 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG13O75143 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG13O75143 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG13O75143 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG13O75143 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG13O75143 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG13O75143 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG13O75143 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG13O75143 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG13O75143 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG13O75143 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG13O75143 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG13O75143 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG13O75143 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG13O75143 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG13O75143 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG13O75143 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG13O75143 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG13O75143 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG13O75143 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG13O75143 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG13O75143 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG13O75143 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG13O75143 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG13O75143 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG13O75143 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG13O75143 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG13O75143 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG13O75143 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG13O75143 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATG13O75143 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG13O75143 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG13O75143 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG13O75143 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG13O75143 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG13O75143 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG13O75143 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG13O75143 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG13O75143 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG13O75143 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG13O75143 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG13O75143 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG13O75143 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG13O75143 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG13O75143 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG13O75143 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG13O75143 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG13O75143 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG13O75143 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms