Protein–RNA interactions for Protein: O60449

LY75, Lymphocyte antigen 75, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY75O60449 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LY75O60449 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LY75O60449 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LY75O60449 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LY75O60449 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LY75O60449 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LY75O60449 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LY75O60449 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LY75O60449 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LY75O60449 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LY75O60449 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LY75O60449 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LY75O60449 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LY75O60449 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LY75O60449 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LY75O60449 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LY75O60449 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LY75O60449 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LY75O60449 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LY75O60449 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LY75O60449 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LY75O60449 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LY75O60449 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LY75O60449 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LY75O60449 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LY75O60449 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LY75O60449 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LY75O60449 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LY75O60449 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LY75O60449 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LY75O60449 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LY75O60449 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LY75O60449 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LY75O60449 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LY75O60449 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LY75O60449 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LY75O60449 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LY75O60449 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LY75O60449 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LY75O60449 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LY75O60449 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LY75O60449 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LY75O60449 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LY75O60449 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LY75O60449 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LY75O60449 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LY75O60449 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LY75O60449 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LY75O60449 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LY75O60449 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LY75O60449 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LY75O60449 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LY75O60449 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LY75O60449 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LY75O60449 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LY75O60449 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LY75O60449 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LY75O60449 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LY75O60449 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LY75O60449 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LY75O60449 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LY75O60449 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LY75O60449 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LY75O60449 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LY75O60449 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LY75O60449 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LY75O60449 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LY75O60449 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LY75O60449 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LY75O60449 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LY75O60449 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LY75O60449 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LY75O60449 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LY75O60449 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LY75O60449 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LY75O60449 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LY75O60449 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LY75O60449 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LY75O60449 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LY75O60449 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LY75O60449 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LY75O60449 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LY75O60449 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LY75O60449 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LY75O60449 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LY75O60449 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LY75O60449 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LY75O60449 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LY75O60449 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LY75O60449 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
LY75O60449 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LY75O60449 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
LY75O60449 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LY75O60449 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LY75O60449 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
LY75O60449 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LY75O60449 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LY75O60449 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LY75O60449 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LY75O60449 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms