Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms