Protein–RNA interactions for Protein: O43805

SSNA1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSNA1O43805 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SSNA1O43805 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSNA1O43805 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSNA1O43805 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSNA1O43805 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSNA1O43805 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSNA1O43805 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSNA1O43805 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSNA1O43805 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSNA1O43805 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSNA1O43805 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSNA1O43805 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSNA1O43805 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSNA1O43805 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSNA1O43805 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSNA1O43805 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSNA1O43805 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSNA1O43805 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSNA1O43805 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSNA1O43805 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSNA1O43805 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSNA1O43805 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSNA1O43805 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSNA1O43805 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSNA1O43805 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSNA1O43805 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSNA1O43805 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSNA1O43805 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSNA1O43805 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSNA1O43805 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSNA1O43805 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SSNA1O43805 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSNA1O43805 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSNA1O43805 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSNA1O43805 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSNA1O43805 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSNA1O43805 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSNA1O43805 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSNA1O43805 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSNA1O43805 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSNA1O43805 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSNA1O43805 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSNA1O43805 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSNA1O43805 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSNA1O43805 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSNA1O43805 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSNA1O43805 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSNA1O43805 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSNA1O43805 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSNA1O43805 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSNA1O43805 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSNA1O43805 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SSNA1O43805 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSNA1O43805 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSNA1O43805 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSNA1O43805 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSNA1O43805 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSNA1O43805 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSNA1O43805 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSNA1O43805 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSNA1O43805 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSNA1O43805 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSNA1O43805 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSNA1O43805 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSNA1O43805 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSNA1O43805 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SSNA1O43805 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSNA1O43805 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSNA1O43805 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSNA1O43805 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSNA1O43805 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSNA1O43805 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSNA1O43805 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSNA1O43805 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSNA1O43805 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSNA1O43805 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSNA1O43805 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SSNA1O43805 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSNA1O43805 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSNA1O43805 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSNA1O43805 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSNA1O43805 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSNA1O43805 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSNA1O43805 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSNA1O43805 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSNA1O43805 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSNA1O43805 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSNA1O43805 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSNA1O43805 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSNA1O43805 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SSNA1O43805 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSNA1O43805 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSNA1O43805 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SSNA1O43805 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSNA1O43805 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSNA1O43805 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSNA1O43805 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSNA1O43805 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSNA1O43805 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SSNA1O43805 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms