Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGR2O43760 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms