Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms