Protein–RNA interactions for Protein: O14529

CUX2, Homeobox protein cut-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX2O14529 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
CUX2O14529 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC33.76■■■■□ 3
CUX2O14529 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
CUX2O14529 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC33.76■■■■□ 3
CUX2O14529 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
CUX2O14529 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.76■■■■□ 3
CUX2O14529 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
CUX2O14529 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
CUX2O14529 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
CUX2O14529 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
CUX2O14529 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CUX2O14529 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
CUX2O14529 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
CUX2O14529 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CUX2O14529 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CUX2O14529 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CUX2O14529 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
CUX2O14529 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CUX2O14529 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CUX2O14529 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CUX2O14529 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CUX2O14529 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
CUX2O14529 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CUX2O14529 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CUX2O14529 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CUX2O14529 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CUX2O14529 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CUX2O14529 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CUX2O14529 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CUX2O14529 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CUX2O14529 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CUX2O14529 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CUX2O14529 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
CUX2O14529 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CUX2O14529 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CUX2O14529 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CUX2O14529 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CUX2O14529 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CUX2O14529 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CUX2O14529 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
CUX2O14529 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CUX2O14529 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CUX2O14529 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CUX2O14529 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CUX2O14529 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CUX2O14529 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CUX2O14529 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CUX2O14529 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CUX2O14529 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CUX2O14529 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CUX2O14529 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CUX2O14529 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CUX2O14529 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CUX2O14529 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CUX2O14529 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CUX2O14529 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CUX2O14529 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CUX2O14529 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CUX2O14529 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CUX2O14529 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
CUX2O14529 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CUX2O14529 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
CUX2O14529 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CUX2O14529 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
CUX2O14529 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CUX2O14529 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CUX2O14529 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CUX2O14529 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CUX2O14529 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CUX2O14529 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CUX2O14529 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
CUX2O14529 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CUX2O14529 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CUX2O14529 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CUX2O14529 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CUX2O14529 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CUX2O14529 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CUX2O14529 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CUX2O14529 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CUX2O14529 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CUX2O14529 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CUX2O14529 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
CUX2O14529 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CUX2O14529 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CUX2O14529 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CUX2O14529 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
CUX2O14529 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CUX2O14529 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CUX2O14529 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CUX2O14529 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CUX2O14529 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CUX2O14529 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
CUX2O14529 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
CUX2O14529 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CUX2O14529 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CUX2O14529 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CUX2O14529 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CUX2O14529 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CUX2O14529 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CUX2O14529 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms