Protein–RNA interactions for Protein: O00712

NFIB, Nuclear factor 1 B-type, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIBO00712 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIBO00712 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIBO00712 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIBO00712 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIBO00712 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIBO00712 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIBO00712 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIBO00712 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIBO00712 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIBO00712 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIBO00712 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIBO00712 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIBO00712 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFIBO00712 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFIBO00712 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFIBO00712 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFIBO00712 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFIBO00712 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFIBO00712 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NFIBO00712 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFIBO00712 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFIBO00712 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFIBO00712 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFIBO00712 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFIBO00712 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFIBO00712 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFIBO00712 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFIBO00712 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFIBO00712 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIBO00712 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIBO00712 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIBO00712 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIBO00712 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIBO00712 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIBO00712 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIBO00712 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIBO00712 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIBO00712 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIBO00712 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIBO00712 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIBO00712 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIBO00712 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIBO00712 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIBO00712 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIBO00712 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIBO00712 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIBO00712 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFIBO00712 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NFIBO00712 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFIBO00712 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFIBO00712 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFIBO00712 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFIBO00712 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFIBO00712 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFIBO00712 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFIBO00712 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFIBO00712 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NFIBO00712 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFIBO00712 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NFIBO00712 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFIBO00712 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFIBO00712 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFIBO00712 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NFIBO00712 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFIBO00712 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFIBO00712 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFIBO00712 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NFIBO00712 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NFIBO00712 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFIBO00712 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFIBO00712 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFIBO00712 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFIBO00712 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFIBO00712 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NFIBO00712 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFIBO00712 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFIBO00712 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFIBO00712 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFIBO00712 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFIBO00712 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFIBO00712 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFIBO00712 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFIBO00712 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFIBO00712 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFIBO00712 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFIBO00712 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFIBO00712 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFIBO00712 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFIBO00712 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFIBO00712 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFIBO00712 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFIBO00712 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NFIBO00712 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NFIBO00712 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
NFIBO00712 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NFIBO00712 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NFIBO00712 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NFIBO00712 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFIBO00712 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFIBO00712 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms