Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PIK3C2AO00443 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms