Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DFFAO00273 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DFFAO00273 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DFFAO00273 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DFFAO00273 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DFFAO00273 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DFFAO00273 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DFFAO00273 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DFFAO00273 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DFFAO00273 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DFFAO00273 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DFFAO00273 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DFFAO00273 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DFFAO00273 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DFFAO00273 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DFFAO00273 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DFFAO00273 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DFFAO00273 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DFFAO00273 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
DFFAO00273 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DFFAO00273 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DFFAO00273 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DFFAO00273 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DFFAO00273 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
DFFAO00273 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DFFAO00273 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DFFAO00273 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DFFAO00273 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DFFAO00273 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DFFAO00273 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DFFAO00273 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DFFAO00273 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DFFAO00273 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DFFAO00273 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DFFAO00273 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DFFAO00273 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DFFAO00273 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DFFAO00273 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DFFAO00273 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DFFAO00273 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DFFAO00273 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DFFAO00273 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DFFAO00273 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DFFAO00273 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DFFAO00273 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DFFAO00273 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DFFAO00273 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DFFAO00273 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DFFAO00273 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DFFAO00273 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DFFAO00273 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DFFAO00273 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DFFAO00273 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DFFAO00273 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DFFAO00273 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DFFAO00273 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DFFAO00273 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DFFAO00273 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DFFAO00273 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DFFAO00273 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DFFAO00273 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DFFAO00273 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DFFAO00273 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DFFAO00273 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DFFAO00273 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DFFAO00273 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DFFAO00273 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DFFAO00273 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DFFAO00273 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DFFAO00273 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DFFAO00273 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DFFAO00273 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DFFAO00273 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DFFAO00273 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DFFAO00273 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DFFAO00273 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DFFAO00273 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DFFAO00273 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DFFAO00273 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DFFAO00273 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DFFAO00273 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DFFAO00273 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DFFAO00273 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DFFAO00273 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DFFAO00273 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DFFAO00273 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DFFAO00273 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DFFAO00273 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DFFAO00273 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DFFAO00273 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DFFAO00273 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DFFAO00273 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DFFAO00273 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DFFAO00273 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DFFAO00273 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DFFAO00273 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DFFAO00273 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DFFAO00273 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DFFAO00273 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DFFAO00273 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms