Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
J3KT08 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
J3KT08 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
J3KT08 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
J3KT08 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
J3KT08 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
J3KT08 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
J3KT08 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
J3KT08 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
J3KT08 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
J3KT08 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
J3KT08 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
J3KT08 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
J3KT08 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
J3KT08 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
J3KT08 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
J3KT08 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
J3KT08 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
J3KT08 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
J3KT08 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC12.19□□□□□ -0.46
J3KT08 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
J3KT08 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
J3KT08 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
J3KT08 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
J3KT08 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
J3KT08 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
J3KT08 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
J3KT08 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
J3KT08 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
J3KT08 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
J3KT08 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
J3KT08 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
J3KT08 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
J3KT08 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
J3KT08 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
J3KT08 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
J3KT08 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
J3KT08 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
J3KT08 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
J3KT08 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
J3KT08 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
J3KT08 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
J3KT08 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
J3KT08 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
J3KT08 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
J3KT08 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
J3KT08 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
J3KT08 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
J3KT08 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
J3KT08 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
J3KT08 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
J3KT08 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
J3KT08 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
J3KT08 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
J3KT08 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
J3KT08 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
J3KT08 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
J3KT08 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
J3KT08 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
J3KT08 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
J3KT08 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
J3KT08 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
J3KT08 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
J3KT08 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
J3KT08 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
J3KT08 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
J3KT08 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
J3KT08 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
J3KT08 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
J3KT08 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
J3KT08 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
J3KT08 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
J3KT08 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
J3KT08 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
J3KT08 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
J3KT08 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
J3KT08 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
J3KT08 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.17□□□□□ -0.46
J3KT08 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
J3KT08 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
J3KT08 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
J3KT08 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
J3KT08 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
J3KT08 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
J3KT08 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
J3KT08 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
J3KT08 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
J3KT08 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
J3KT08 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
J3KT08 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
J3KT08 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
J3KT08 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
J3KT08 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
J3KT08 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
J3KT08 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
J3KT08 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
J3KT08 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
J3KT08 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
J3KT08 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
J3KT08 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms