Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERVV-2B6SEH9 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms