Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
B4DGG1 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
B4DGG1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
B4DGG1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
B4DGG1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
B4DGG1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
B4DGG1 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
B4DGG1 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
B4DGG1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
B4DGG1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
B4DGG1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
B4DGG1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
B4DGG1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
B4DGG1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
B4DGG1 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
B4DGG1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
B4DGG1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
B4DGG1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
B4DGG1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
B4DGG1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
B4DGG1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
B4DGG1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
B4DGG1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
B4DGG1 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
B4DGG1 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
B4DGG1 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
B4DGG1 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
B4DGG1 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
B4DGG1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
B4DGG1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
B4DGG1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
B4DGG1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
B4DGG1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
B4DGG1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
B4DGG1 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
B4DGG1 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
B4DGG1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
B4DGG1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
B4DGG1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
B4DGG1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
B4DGG1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
B4DGG1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
B4DGG1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
B4DGG1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
B4DGG1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
B4DGG1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
B4DGG1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
B4DGG1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
B4DGG1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
B4DGG1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
B4DGG1 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
B4DGG1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
B4DGG1 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
B4DGG1 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
B4DGG1 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
B4DGG1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
B4DGG1 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
B4DGG1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
B4DGG1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
B4DGG1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
B4DGG1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
B4DGG1 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
B4DGG1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
B4DGG1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
B4DGG1 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
B4DGG1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
B4DGG1 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
B4DGG1 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
B4DGG1 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
B4DGG1 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
B4DGG1 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
B4DGG1 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
B4DGG1 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
B4DGG1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
B4DGG1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
B4DGG1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
B4DGG1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
B4DGG1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
B4DGG1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
B4DGG1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
B4DGG1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
B4DGG1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
B4DGG1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
B4DGG1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
B4DGG1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
B4DGG1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
B4DGG1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
B4DGG1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
B4DGG1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
B4DGG1 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
B4DGG1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
B4DGG1 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
B4DGG1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
B4DGG1 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
B4DGG1 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
B4DGG1 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
B4DGG1 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
B4DGG1 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
B4DGG1 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
B4DGG1 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms