Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C9orf92A6NGG3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms