Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms