Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00862A6NCI5 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms