Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLHL33A6NCF5 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL33A6NCF5 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL33A6NCF5 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL33A6NCF5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL33A6NCF5 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL33A6NCF5 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL33A6NCF5 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL33A6NCF5 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL33A6NCF5 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL33A6NCF5 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL33A6NCF5 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL33A6NCF5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL33A6NCF5 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL33A6NCF5 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL33A6NCF5 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL33A6NCF5 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL33A6NCF5 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL33A6NCF5 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL33A6NCF5 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL33A6NCF5 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL33A6NCF5 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL33A6NCF5 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL33A6NCF5 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL33A6NCF5 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL33A6NCF5 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL33A6NCF5 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL33A6NCF5 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL33A6NCF5 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL33A6NCF5 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL33A6NCF5 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL33A6NCF5 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL33A6NCF5 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL33A6NCF5 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL33A6NCF5 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL33A6NCF5 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL33A6NCF5 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL33A6NCF5 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL33A6NCF5 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL33A6NCF5 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL33A6NCF5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL33A6NCF5 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL33A6NCF5 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL33A6NCF5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL33A6NCF5 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL33A6NCF5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL33A6NCF5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL33A6NCF5 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL33A6NCF5 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL33A6NCF5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL33A6NCF5 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL33A6NCF5 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL33A6NCF5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL33A6NCF5 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL33A6NCF5 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL33A6NCF5 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL33A6NCF5 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL33A6NCF5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL33A6NCF5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL33A6NCF5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL33A6NCF5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL33A6NCF5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL33A6NCF5 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL33A6NCF5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL33A6NCF5 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL33A6NCF5 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL33A6NCF5 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL33A6NCF5 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL33A6NCF5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL33A6NCF5 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL33A6NCF5 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL33A6NCF5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL33A6NCF5 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL33A6NCF5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL33A6NCF5 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL33A6NCF5 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL33A6NCF5 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL33A6NCF5 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL33A6NCF5 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL33A6NCF5 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL33A6NCF5 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL33A6NCF5 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL33A6NCF5 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL33A6NCF5 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL33A6NCF5 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL33A6NCF5 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL33A6NCF5 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL33A6NCF5 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL33A6NCF5 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL33A6NCF5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL33A6NCF5 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL33A6NCF5 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL33A6NCF5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL33A6NCF5 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL33A6NCF5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL33A6NCF5 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL33A6NCF5 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL33A6NCF5 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL33A6NCF5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL33A6NCF5 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms