Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC12□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC12□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC12□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC12□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms